La tesi se centra en el desenvolupament d’una eina de diagnosi ràpida per detectar gens de resistència antimicrobiana en garrins i orientar l’ús dels antibiòtics de manera més responsable

La investigadora postdoctoral Judith Guitart Matas ha rebut el primer accèssit Profesor Valentín Pérez de la 29a edició dels Premis SYVA Internacional a la Millor Tesi en Sanitat Animal per la seva tesi doctoral realitzada a l’IRTA entre el 2021 i el 2025. La investigació està centrada en l’ús de tecnologies multi-òmiques per estudiar les resistències als antibiòtics en diarrees post-deslletament en garrins. La tesi, dirigida pels investigadors Lourdes Migura Garcia (Programa Sanitat Animal), Maria Ballester i Yuliaxis Ramayo Caldas (Programa Millora i Genètica Animal), va ser finançada per una IRTA fellowship de l’iniciativa estratègica per a la reducció de l’ús d’antimicrobians en producción animal.

Aquests premis són un dels reconeixements de referència al talent investigador jove en l’àmbit de la sanitat animal a l’Estat espanyol i a escala internacional. En la seva 29a edició, el jurat va avaluar 31 tesis doctorals procedents de 15 universitats de 7 països. Durant l’acte de lliurament, celebrat a León, la Judith va presentar els resultats de la seva recerca, en què el jurat va destacar «la combinació de tècniques bioinformàtiques d’última generació amb treballs experimentals clàssics i la seva relació directa amb la salut pública».

Un catàleg amb 102 gens de resistència a antimicrobians

La tesi s’emmarca dins del projecte finançat per l’Agencia Estatal d’Investigació (Optimització del diagnòstic i els tractaments de las diarrees post-detellament en el sector porcí: cap un ús racional dels antibiòtics, RTI2018-095586-B-C22). El treball es focalitza en el període de deslletament dels garrins, una etapa crítica en la qual els animals pateixen estrès pel canvi de dieta, la separació de la mare i el trasllat a un nou entorn amb nous companys. Aquests canvis els fan especialment susceptibles a diarrees post-deslletament, que habitualment requereixen tractament antibiòtic.

En aquest context, la tesi combina tècniques de metagenòmica i metatranscriptòmica per analitzar l’efecte de differents estratègies comunes per al tracament de les diarrees post-deslletament en la microbiota intestinal. Així mateix, també s’avaluen els gens de resistència als antimicrobians seleccionats pels differents tractaments,  evidenciant l quins s’expressen activament. Com a resultat, es va obtenir un catàleg de 102 gens de resistència que posteriorment, va ser implementat en una plataforma d’alt rendiment utilitzada com a eina de monitorització. Aquesta plataforma permet fer una vigilància eficient de les resistències antimicrobianes a partir de mostres fecals porcines i obre la porta a decisions terapèutiques més ràpides i fonamentades.

La recerca connecta directament amb el concepte One Health, atès que les resistències als antimicrobians poden circular i transmetre’s entre els animals, els humans i l’ambient. Els resultats de la seva tesi s’han publicat en tres articles, dos a la revista Animal Microbiome: ‘Gut microbiome and resistome characterization of pigs treated with commonly used post-weaning diarrhea treatments’ (2024) i ‘Multi-omics surveillance of antimicrobial resistance in the pig gut microbiome’ (2025), i el darrer a la revista Microbial Genomics: ‘Implementation of a high-throughput microbluidic platform for antimicrobial resistance surveillance in swine production systems’ (2026).

Així mateix, la investigadora va tenir l’oportunitat de fer una estada durant l’etapa doctoral a la Norwegian University of Life Sciences (Noruega)  gràcies a un ajut de mobilitat proporcionat per la European Molecular Biology Organization (EMBO)

Compromís de l’IRTA amb el talent investigador

Des de l’IRTA, treballem constantment en la promoció del talent. El cas de la Judith Guitart n’és un clar exemple. La seva vinculació amb l’IRTA va començar fa nou anys amb les pràctiques de grau i, posteriorment, de màster, que van donar peu a l’inici del seu doctorat l’any 2021. Li donem l’enhorabona per la seva trajectòria i per un premi que reconeix l’excel·lència de la seva tasca.