Anàlisi del microbioma i del genoma en el germoplasma de la pomera per a ampliar els recursos genètics amb la finalitat d’obtenir varietats resistents.

La baixa agrobiodiversidad i la menor capacitat de resposta a les creixents tensions relacionades amb el canvi climàtic són efectes perjudicials de l'actual agricultura d'alts inputs. Els horts comercials de pomes són un exemple perfecte de pràctiques intensives de pesticides i reg que van en contra de les ambicions de la UE de reduir els inputs externs i revertir la degradació de la agrobiodiversidad per a 2030. En aquest context, les noves pràctiques de cria i gestió mostren un gran potencial per a sortir d'aquest cercle viciós i permetre el desenvolupament de agroecosistemas diversos i resistents que requereixin menys pesticides i reg. La millora genètica s'ha basat tradicionalment en la selecció fenotípica de poblacions segregantes. En les últimes dècades, els marcadors moleculars i la selecció genòmica s'han incorporat als plans de millora. Aquestes eines s'han centrat principalment en les associacions genotipo-tret. El microbioma associat a les plantes és conegut des de fa temps per la seva contribució vital al rendiment dels cultius. No obstant això, les pràctiques agrícoles i la millora genètica han prestat poca atenció a la regulació directa i a l'ús de les funcions microbianes beneficioses per a l'hoste. AppleBIOME investigarà l'acció combinada de la genètica de l'hoste i del microbioma (enfocament holobionte) sota pràctiques de gestió d'alts i baixos inputs per a impulsar l'obtenció de varietats resistents.